На сегодняшний день ЮКГУ им.М.Ауэзова имеет совместные договора и меморандумы о сотрудничестве с 180 + высшими учебными заведениями, организациями и научно-исследовательскими институтами, из 24 стран дальнего и ближнего зарубежья: Германии, Австрии, Болгарии, Испании, Италии, Бельгии, Румынии и другие страны.
Академическая мобильность важна для личного развития, она воспитывает уважение к разнообразию и дает возможность культурного обогащения. Южно-Казахстанский Государственный Университет в рамках программы академической мобильности дает возможность своим студентам пройти обучение в зарубежном ВУЗе-партнере.
В 2020 году ЮКГУ им. М.Ауэзова и ETS Global Eastern Europe заключили глобальное соглашение о привилегированных ассоциированных компаниях ERS (EPA) по открытию эксклюзивного Регионального Центра TOEFL (ITP) на базе ЮКГУ им.М.Ауэзова, получив право на проведение стандартизированного теста TOEFL (ITP) в Казахстане. Центр является единственным в Южном регионе тестовым центром, получившим право на распространение продукции и услуг ETS Global по данному тесту.
Для поступления в ЮКГУ им.М.Ауэзова иностранным гражданам оформляется виза для получения образования категории (С9) согласно совместному Приказу МВД РК и МИД РК «Об утверждении Правил оформления приглашений, согласования приглашений на въезд иностранцев и лиц без гражданства в Республику Казахстан, выдачи, аннулирования, восстановления виз Республики Казахстан, а также продления и сокращения сроков их действия» Совместный приказ исполняющего обязанности Министра иностранных дел Республики Казахстан от 24 ноября 2016 года № 11-1-2/555 и Министра внутренних дел Республики Казахстан от 28 ноября 2016 года № 1100. Зарегистрирован в Министерстве юстиции Республики Казахстан 15 декабря 2016 года № 14531.
ЮКГУ им. М.Ауэзова ежегодно устанавливает и поддерживает контакты по вопросам совершенствования партнерских отношений с организациями образования и науки